JS NewsPlus - шаблон joomla Продвижение

Publikasi

Panca Jarot Santoso1*, Ellina Mansyah1, and Adi Pancoro2
1Balai Penelitian tanaman Buah Tropika, Balitbang Kementrian Pertanian, Sumbar, 27301
2Sekolah Ilmu dan Teknologi Hayati, Institut Teknologi Bandung
*Corresponding address: Alamat email ini dilindungi dari robot spam. Anda memerlukan Javascript yang aktif untuk melihatnya.

ABSTRAK

Analisis filogenetik telah dilaksanakan terhadap 12 kasesi manggis (Garcinia mangostana L.) berdasarkan polimorfisme gen lestari ITS-nrDNA. Penelitian telah dilaksanakan di Laboratorium Genetika Tumbuhan SITH-ITB dan Laboratorium Pemuliaan Balitbu Tropika dari tahun 2012 sampai 2014. DNA genom diisolasi dari pucuk muda daun manggis. Daerah lestari ITS diamplifikasi menggunakan primer spesifik ITS5-F dan ITS4-R. Pohon filogenetik dikonstrusi berdasarkan polimorfisme dari sekuens ITS masing-masing aksesi menggunakan perangkat lunak Geneious ver. 5.5.7 menggunakan satu aksesi   G. dulcis sebagai outgroup. Berdasarkan filodendrogram yang terbentuk, menunjukkan bahwa semua sampel yang dianalisis umumnya terdistribusi secara monofiletik, menunjukkan bahwa sampel-sampel tersebut berasal dari satu moyang yang sama. Sebelas dari 12 sampel telah tergroup dalam spesies G. mangostana, sebaliknya varietas ‘Malinau’ secara meyakinkan berada di luar group, yang menunjukkan bahwa ‘Malinau’ merupakan beda spesies dengan 11 sample lain yang digunakan dalam studi ini. Fakta ini didukung oleh karakteristik morfologi yang berbeda pada

‘Malinau dibandingkan dengan 11 aksesi lainnya.

Kata kunci: G. mangostana,  Malinau, filogenetik, ITS-nrDNA

Fulltext

 

Emmanuel Bonifacio S. Timog*, Yosi Zendra Joni, Renerio P. Gentallan Jr., Nestor C. Altoveros, Teresita H. Borromeo, Leah E. Endonela and Antonio G. Lalusin
Institute of Crop Science, College of Agriculture and Food Science, University of the Philippines Los Baños, College, Laguna

ABSTRACT

Out of 28 SSR markers screened, seven (25%) markers were found to stable, reproducible and highly polymorphic  amplifications  in 16 Artocarpus  heterophyllus accessions  and 5 related  species.  The number  of alleles  per marker  ranged  from  6 to 17 with a PIC per marker  ranging  from  0.73 to 0.89. The haplotype  also showed unique  banding  patterns  in  the  21  accessions  of  Artocarpus  across  the  seven  primers  with  67% similarity.  This  denotes  a potentially  successful  interfamilial  amplification  and transferability  of the selected SSR markers to jackfruit.

Key words: Artocarpus heterophyllus, transferability, microsatellite markers.

Indian J. Hort. 76(3), September 2019: 377-381

Fulltext klik disini